本校廢棄物的產出可分為一般事業廢棄物、資源回收物及有害事業廢棄物：
一般廢棄物：委託合格廠清運至合法焚化廠處理。
3. 資源回收物：本校工友送至校外資源回收場或請慈濟單位來校回收。目前於校園各大樓之適當位置設置資源回收桶及廚餘桶，並於校區設置資源垃圾回收處理場，確實回收師生用餐廚餘、各項資源回收垃圾等。
4. 有害事業廢棄物：
3.1.為提昇本校有害事業廢棄物管理成效，於2008.1.4訂定「實驗室廢棄物清運管理辦法」及「實驗室廢棄物清運處理流程圖」，詳細規範實驗室對於有害事業廢棄物之前處理、清洗、確實分類、封存、標示、點核、填寫清點表等運作行為，確保有害事業廢棄物管理成效與落實廢棄物分類標準及清除處理規範。
3.2.另針對有害事業廢棄物統計部分，自2010年4月起即每月月初及月底上網「事業廢棄物申報及管理資訊系統」依現況統計向環保署申報本校「有害事業廢棄物產出情形」及「有害事業廢棄物貯存情形」。